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JCGG事務局
(独)理化学研究所 
グローバル研究クラスタ
システム糖鎖生物学研究グループ

〒351-0198
埼玉県和光市広沢 2-1
(TEL: 048-467-9613,
FAX: 048-462-4692)

研究リソース

糖鎖関連遺伝子DNAマイクロアレイ ご利用について

 ヒトおよびマウスの糖関連遺伝子を搭載したDNAマイクロアレイは当初理研フロンティア研究システム小堤研究員の下で作製され、以後、同システム糖鎖生物学研究グループが引継ぎ、作製、管理および供与を行って参りました。

 このたび、ヒト版ニューアレイを整えましたので、ご利用の一層の便宜を計るため、窓口を日本糖鎖科学コンソーシアム(JCGG)事務局におき、下記にご利用案内を定めましたのでご参照下さい。

 なお、本アレイの研究成果はJCGGのHPにて公開し、糖鎖研究の発展に寄与することを趣旨としておりますのでご了承下さい。

DNAマイクロアレイ 糖鎖関連DNAマイクロアレイ

(1)ご利用方法について

本アレイのご利用をご希望の方は、申込書(別添)をJCGG事務局宛ご提出下さい。
(E-mail、FAX、郵送など)
アレイ実験はご担当者が理研へ直接お越しいただき、ご自身で実験・解析頂くことを基本といたします。
実験に先立ち、MTAを交わした後、polyA RNA試料をご郵送いただき、担当者がquality checkで量・質の確認し、実験可否のご連絡を差し上げます。
一連の実験作業時間は、polyA RNAのラベル化からハイブリダイゼーション、Scanning、解析まで全2日間を要します。

実験の手順につきましては、別紙プロトコールをご参照下さい。
ご希望に応じてアレイ実験の技術的相談にお応えいたします。

ご相談は 藤縄 玲子(ふじなわれいこ)へお寄せ下さい。
 tel & fax :048-467-8699 (内線6621)
 

なお、試料のみを準備されアレイ実験を委託希望の方は、システム糖鎖生物学研究グループ研究者との共同研究扱いとなりますので、別途ご相談下さい。
http://www.riken.jp/r-world/research/lab/frontier-rs/sys-gly/index.html

(2)使用枚数・費用負担等について

1枚のマイクロアレイ上には個々の遺伝子がduplicateでspotしてあります。
実験は1組のサンプルにつきアレイ1枚を用い、duplicateで行うのを基本とします。ご使用枚数は1研究室あたりマウス版・ヒト版合計5枚を限度とし、無償といたします。6枚以上必要な場合は、ラベリング試薬のご購入をお願いいたします。(通常、アレイのラベリングには1枚あたり2万円ほどかかります。ラベリング試薬は1箱で12枚分のラベルが可能となっております)

(3)臨床由来サンプルに関する注意

実験に供されるサンプルが、一般に流通しており商業的に入手可能なもの以外のヒト由来の細胞株や組織である場合は、提供者あるいはその代理人の同意書が必要です。同意書のフォーマットに指定はありませんが、本人か代理人かが明示されており、「他施設で解析する」旨の記載のあることが必要です。
また、サンプルの匿名化もお願いいたします。臨床由来サンプルの場合には、実験に先立ち、理研倫理委員会の承認を得る必要もありますので、まずはご相談下さい。
(参照 http://www.mhlw.go.jp/houdou/0103/h0329-3.html

(4)データの公開について

本プロジェクトでは、マイクロアレイの実験結果についてご利用者のご協力をいただき、半年後を目処に、JCGGDB(http://jcggdb.jp/)上で公開し、研究者への便宜を図りたいと考えております。

(5)研究者間の研究内容の調整について

研究者間で研究内容が重複した場合は、当該研究者にお知らせいたしますので、相互調整をお願いいたします。(当方では調整をいたしません)

(6)論文掲載について

論文には必ず本アレイを使用したことを明記していただきます。


 以上、不明な点は下記へお問合せ下さい。なお、上記事項は予算などの都合により変更する場合がありますのでご了承ください。

連絡先: 〒 351-0198埼玉県和光市広沢2-1  
独立行政法人 理化学研究所 基幹研究所 
システム糖鎖生物学研究グループ 気付
日本糖鎖科学コンソーシアム(JCGG)事務局 吉田 圭一

電話   048−467−9613
FAX  048−462−4692

添付:
(1) 実験手順および留意事項 (steps.doc)
(2) 利用申込書 (application.xls)
(3) MTA書類 (mta.doc)
(4) マイクロアレイ搭載一覧表(ヒト) (humanlist_ver4.xls)
(5) マイクロアレイ搭載一覧表(マウス) (mouselist_ver2.xls)